Mae ecoleg amaethyddol yn delio â'r problemau amgylcheddol y mae gweithgareddau amaeth-ddiwydiannol yn eu cynhyrchu. O ganlyniad, ceisir newid gweithredoedd a datblygu dulliau a fydd yn lleihau'r effeithiau niweidiol ar natur.
Ecsbloetio pridd
Prif adnodd agro-ecosystemau yw tir. Defnyddir ardaloedd mawr ar gyfer caeau, a defnyddir porfeydd ar gyfer pori anifeiliaid. Mewn amaethyddiaeth, defnyddir y pridd yn rheolaidd, defnyddir gwrteithwyr a phlaladdwyr, amrywiol ddulliau o dyfu, sy'n arwain at salinization a disbyddu'r pridd. Yn y dyfodol, mae'r tir yn colli ei ffrwythlondeb, yn colli ei lystyfiant, mae erydiad pridd yn digwydd ac mae'r diriogaeth yn troi'n anialwch.
Mae ecoleg amaethyddol yn ystyried sut mae angen adfer tir ar ôl ei ddefnyddio'n ddwys, sut i ecsbloetio adnoddau tir yn iawn. Mae amgylcheddwyr o blaid lleihau'r defnydd o wrteithwyr ac agrocemegion, datblygu sylweddau newydd, llai ymosodol a niweidiol.
Tramplo'r pridd gyda da byw
Mae codi da byw yn golygu pori gwartheg mewn porfeydd. Mae anifeiliaid yn bwyta planhigion amrywiol ac yn sathru'r ddaear, sy'n arwain at ei ddinistrio. O ganlyniad, mae nifer fach o gnydau yn aros ar y diriogaeth hon, neu nid yw planhigion yn tyfu o gwbl. Gan fod y glaswellt yn cael ei ddefnyddio gan anifeiliaid o'r gwreiddyn, nid yw'r pridd yn gallu gwella ar ei ben ei hun, sy'n arwain at ei ddiffeithwch. Wrth i'r tir ddod yn anaddas ar gyfer pori pellach, mae tiriogaethau newydd yn cael eu datblygu. Er mwyn osgoi canlyniadau o'r fath, mae angen defnyddio'r borfa yn gywir, arsylwi ar y normau a gofalu am y tir.
Glaw asid
Nid y ffenomen negyddol olaf mewn amaethyddiaeth yw glaw asid. Maen nhw'n llygru'r pridd, ac mae'r holl gnydau sydd wedi cael glawiad gwenwynig yn dod yn beryglus neu'n marw allan. O ganlyniad, mae maint y cnydau yn cael ei leihau, ac mae'r tir yn dirlawn â chemegau ac yn dod yn anaddas.
Mae gweithgareddau amaethyddol yn cael effaith sylweddol ar yr amgylchedd. Mae'r defnydd o adnoddau naturiol yn arwain at y ffaith bod y pridd yn colli ei allu i wella, cwympo a marw yn y dyfodol. Mae hyn yn arwain at newidiadau mewn ecosystemau, diraddiad amgylcheddol. Dim ond trwy ddefnydd rhesymol o adnoddau naturiol y gellir osgoi trychinebau ecolegol o'r fath.